La Oficina contra la Violencia Institucional tiene a su cargo los casos más graves de violencia sufridos por personas bajo custodia estatal, es decir, aquellas que se encuentran privadas de libertad en cárceles o centros de detención, así como los procedimientos de aprehensión policial y traslados de estas personas. Los casos más graves comprenden aquellos que resultan en muertes, lesiones gravísimas o graves de las personas bajo custodia del Estado.