El Administrador General del Ministerio Público de la Defensa depende funcional y jerárquicamente de la máxima autoridad del organismo y ostenta la más alta jerarquía dentro de la organización administrativa del Ministerio Público de la Defensa. Su función esencial consiste en la programación, ejecución, coordinación y control de la administración general del organismo, así como en el cumplimiento de las funciones de superintendencia que le sean encomendadas.